Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms