Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm8356J3QPD3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm8356J3QPD3 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm8356J3QPD3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm8356J3QPD3 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm8356J3QPD3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm8356J3QPD3 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm8356J3QPD3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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