Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms