Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm20815J3KMI0 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms