Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-203ENSMUST00000105941 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-204ENSMUST00000105942 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-205ENSMUST00000105943 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-207ENSMUST00000105945 747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tnnt3-208ENSMUST00000105946 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Usp9yF8VPU6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Usp9yF8VPU6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Usp9yF8VPU6 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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Usp9yF8VPU6 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Usp9yF8VPU6 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
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Usp9yF8VPU6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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Usp9yF8VPU6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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Usp9yF8VPU6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
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Usp9yF8VPU6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
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Usp9yF8VPU6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
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