Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm28048F7BCN0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms