Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem200bD3Z0P8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms