Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Phf11bB4XVQ1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Phf11bB4XVQ1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Phf11bB4XVQ1 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms