Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PtprsB0V2N1 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms