Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm6880A3KG45 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms