Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Atp8b5A3FIN4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atp8b5A3FIN4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms