Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ckap5A2AGT5 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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