Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm44636-201ENSMUST00000206130 755 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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