Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mbd1Q9Z2E2 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mbd1Q9Z2E2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms