Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms