Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Znf346Q9R0B7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.5 ms