Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vstm2bQ9JME9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms