Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms