Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ap4m1Q9JKC7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ap4m1Q9JKC7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms