Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnn1Q9EQR3 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnn1Q9EQR3 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms