Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnft1Q9DCN7 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms