Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hmg20aQ9DC33 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hmg20aQ9DC33 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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