Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Slc46a3Q9DC26 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms