Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ifi35Q9D8C4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Ifi35Q9D8C4 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ifi35Q9D8C4 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Ifi35Q9D8C4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms