Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ptp4a3Q9D658 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms