Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Zcchc13Q9D548 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Zcchc13Q9D548 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Zcchc13Q9D548 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Zcchc13Q9D548 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Zcchc13Q9D548 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
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Zcchc13Q9D548 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Zcchc13Q9D548 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Zcchc13Q9D548 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Zcchc13Q9D548 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Zcchc13Q9D548 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Zcchc13Q9D548 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Zcchc13Q9D548 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Zcchc13Q9D548 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Zcchc13Q9D548 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Zcchc13Q9D548 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Zcchc13Q9D548 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Zcchc13Q9D548 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zcchc13Q9D548 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms