Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef12Q9D2F1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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