Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Khdc3Q9CWU5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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