Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddx28Q9CWT6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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