Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Hps4Q99KG7 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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