Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Krcc1Q99JT5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Krcc1Q99JT5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Krcc1Q99JT5 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Krcc1Q99JT5 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Krcc1Q99JT5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Krcc1Q99JT5 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Krcc1Q99JT5 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Krcc1Q99JT5 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Krcc1Q99JT5 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Krcc1Q99JT5 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Krcc1Q99JT5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Krcc1Q99JT5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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Krcc1Q99JT5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Krcc1Q99JT5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms