Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms