Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg4aQ8C9S8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg4aQ8C9S8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg4aQ8C9S8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg4aQ8C9S8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg4aQ8C9S8 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Atg4aQ8C9S8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Atg4aQ8C9S8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Atg4aQ8C9S8 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Atg4aQ8C9S8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Atg4aQ8C9S8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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