Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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FarsaQ8C0C7 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
FarsaQ8C0C7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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