Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 AC159203.1-201ENSMUST00000222039 769 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trim35Q8C006 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Gzma-202ENSMUST00000224282 996 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim35Q8C006 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms