Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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