Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Atg4dQ8BGV9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg4dQ8BGV9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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