Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms