Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2bQ7TPM1 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms