Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shq1Q7TMX5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Shq1Q7TMX5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Shq1Q7TMX5 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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