Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnih3Q6ZWS4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms