Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms