Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sh3rf1Q69ZI1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sh3rf1Q69ZI1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sh3rf1Q69ZI1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Sh3rf1Q69ZI1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3rf1Q69ZI1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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