Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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