Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ctnna3Q65CL1 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ctnna3Q65CL1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms