Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Klf3Q60980 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms