Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
JrkQ60976 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms