Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf123Q5XPI3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms