Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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Trappc1Q5NCF2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Trappc1Q5NCF2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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