Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ctdnep1Q3TP92 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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